此后两个月，梁思成夫妇把设计方案改了一次又一次：高楼变成了矮楼，矮楼变成了平房，砖墙变成了土墙。几乎每改一次，林徽因都要落一次泪。当梁思成夫妇交出最后一稿设计方案时，建设长黄钰生很无奈地告诉他们：经校委会研究，除了图书馆的屋顶可以使用青瓦，部分教室和校长办公室可以使用铁皮屋顶之外，其他建筑一律覆盖茅草……希望梁思成再做一次调整。
此时的梁思成已经忍无可忍，他冲进梅贻琦的办公室，把设计图纸狠狠地砸在梅贻琦的办公桌上。他痛心地喊道：“改！改！改！你还要我怎么改？我……已经修改到第五稿了，从高楼到矮楼，从矮楼到平房，现在又要我去盖茅草房。茅草房就茅草房吧，你们知不知道农民盖一幢茅草房要多少木料？而你给的木料连盖一幢标准的茅草房都不够！”
梅贻琦叹了口气说：“正因为如此，所以才需要土木工程系的老师们对木材的用量进行严格控制啊……大家都在共赴国难，以你的大度，请再最后谅解我们一次。等抗战胜利后回到北京，我一定请你来建一个世界一流的清华园，算是我还给你的谢意，行吗？”梅贻琦的声音不大，却有些颤，梁思成听着，心又一次软了。那天他流下了眼泪，哭得像一个受伤的孩子……